2006年1月，根據(jù)國務院的決定，中關村科技園區(qū)非上市股份公司進入證券公司代辦股份轉讓系統(tǒng)進行股份轉讓試點。

2010年4月，中國證監(jiān)會成立國家高新技術產(chǎn)業(yè)開發(fā)區(qū)非上市公司股份轉讓試點暨場外市場建設籌備工作領導小組及其工作機構。

2011年2月，國務院副總理王岐山主持會議, 研究證券場外市場建設有關問題。會議要求，逐步探索建立全國統(tǒng)一的證券場外市場。

2011年3月，國務院發(fā)布《中華人民共和國國民經(jīng)濟和社會發(fā)展第十二個五年規(guī)劃綱要》提出：“擴大代辦股份轉讓系統(tǒng)試點，加快發(fā)展場外交易市場。”

2012年3月,中國證監(jiān)會全國場外市場籌備組成立；5月，籌備組工作團隊組建完成。

2012年7月，國務院同意擴大非上市股份公司股份轉讓試點，在中關村園區(qū)基礎上，新增上海張江、武漢東湖、天津濱海高新區(qū)進入試點范圍；同意設立全國中小企業(yè)股份轉讓系統(tǒng)，組建運營管理機構。

2012年9月7日，擴大非上市股份公司股份轉讓試點合作備忘錄簽署暨首批企業(yè)掛牌儀式在京舉行。

2012年9月20日，全國中小企業(yè)股份轉讓系統(tǒng)有限責任公司在國家工商總局完成登記注冊。

2013年1月16日，舉行全國中小企業(yè)股份轉讓系統(tǒng)揭牌儀式。