新三板的交易時間是每周的周一、周三、周五，轉讓委托申報時間為上午的9點15分到11點30分，下午1點到3點，之后的時間以集合競價方式進行集中配對成交。委托的方式采用柜臺、電話和互聯網等方式。新三板的交易結果的顯示有別于A股市場的交易形式。

新三板的擴容范圍限制是北京中關村、天津濱海、上海張江和武漢東湖這四個高新區。新三板的準確叫法叫做股權轉讓系統而不是股票交易市場，這和A股市場是不同的。新三板是不具備發行股票的功能，它是把資產存量證券化后的交易方式，不能在社會上招募新股。這就區別于A股散戶上的投資，從里一個角度來看新三板市場主要是針對高新技術企業或者中小企業，在新三板上掛牌是為A股上市做準備。

新三板主要涉及的是資產的存量而不是增量，在新三板上的融資是為了能更好的積蓄力量為沖刺A股市場積蓄力量。

其實，當初把個人投資新三板的門檻設置的很高也正是為了這個目的。個人投資的資產要在500萬元以上同時還要有2年的相關投資經驗也正是為了更完善的新三板這個市場。相對于A股的自由買賣，這樣做也能更好的保護到中小投資者的利益。

新三板和A股主板市場的最大區別有兩點：

1、上市條件要求不同。主板市場上市條件相對嚴苛得多，例如要求上市之前連續三年凈利潤率必須保持6%以上，而新三板只需要一年即可上市。

2、退市條件也不同。主板A股退市的硬件是連續三年業績虧損，而新三板只需發現嚴重問題就可退市。