目前新三板掛牌公司的股票轉讓可以采取協(xié)議方式、做市方式、競價方式或其他中國證監(jiān)會批準的轉讓方式。目前競價方式還沒有推出，所以目前只有“做市轉讓”和“協(xié)議轉讓”兩種方式。

做市商制度推出以前，新三板僅有協(xié)議轉讓交易一種方式，買賣雙方在場外自主對接形成協(xié)議后，進入股轉系統(tǒng)報價即完成交易。對于這種情況，有人表示理解。價格的變動體現(xiàn)了投資者對公司價值的認定過程，在沒有做市商參與的情況下，認定價格出現(xiàn)巨大差距是可以理解的。但也有業(yè)內人士表示，這種現(xiàn)象將損害新三板的價格發(fā)現(xiàn)功能。雖然做市商制度已經(jīng)推出，但在掛牌企業(yè)良莠不齊的情況下，協(xié)議轉讓還是大部分掛牌企業(yè)會選擇的交易方式，對于偏離內在價值的交易價格，監(jiān)管層應該予以關注。

協(xié)議轉讓：買賣雙方線下議定價格，通常買賣方直接洽談，然后通過股轉系統(tǒng)（新三板）交易。買方要有比較專業(yè)的知識，才能盡可能避免投資失誤。

一、委托方式

投資者委托分為意向委托、定價委托和成交確認委托。

二、申報時間

交易主機接受申報的時間為每個轉讓日的9：15至11：30、13：00至15：00

三、申報類型

全國股份轉讓系統(tǒng)接受主辦券商的意向申報、定價申報和成交確認申報。

1.意向申報不具備成交功能，只向市場發(fā)布，不參與撮合。

2.定價申報報送時，無須填寫約定號，主機系統(tǒng)接受后自動分配約定號。

3.成效確認申報報送時，必須填寫約定號。全國股份轉讓系統(tǒng)收到擬與定價申報成交的成交確認申報后，如系統(tǒng)中無對應的定價申報，該成交確認申報以撤單處理。

四、協(xié)議轉讓成交確認時間

1.每個轉讓日的9：30至11：30、13：00至15：00為協(xié)議轉讓的成交確認時間。

2.9：15—9：30，全國股份轉讓系統(tǒng)僅接受申報，但不對申報進行匹配成效。

五、成交原則

1、成交確認申報與定價申報成交原則：全國股轉系統(tǒng)按照時間優(yōu)先原則，將成交確認申報和與該成交確認申報證券代碼、申報價格相同，買賣方向相反及成交約定號一致的定價申報進行確認成交。成交確認申報與定價申報可以部分成交。成交確認申報未成交部分以撤單處理。

2、互報成交確認申報成交原則：全國股轉系統(tǒng)對證券代碼、申報價格和申報數(shù)量相同，買賣方向相反，指定對手方交易單元、證券賬戶號碼相符及成交約定號一致的成交確認申報進行確認成交。

3、收盤自動匹配成交原則：每個轉讓日 15:00，全國股轉系統(tǒng)按照時間優(yōu)先原則，將證券代碼和申報價格相同、買賣方向相反的未成交定價申報進行匹配成交。