上海股權托管交易中心經上海市政府批準設立，歸屬上海市金融服務辦公室監管，遵循中國證監會對中國多層次資本市場體系建設的統一要求，是上海市國際金融中心建設的重要組成部分，也是中國多層次資本市場體系建設的重要環節。

2012年2月15日，上海股權托管交易中心啟動，首批19家企業成功掛牌。

2015年12月28日，上海股權托管交易中心“科技創新板”正式開板。首批掛牌的企業共27家，其中包括科技型企業21家、創新型企業6家，行業覆蓋互聯網、生物醫藥、再生資源、3D打印等13個新興行業。

上海股權托管交易中心下設掛牌管理部（投資銀行部）、交易管理部（經紀業務部）、登記結算部（市場監管部）、信息技術部、計劃財務部、辦公室（風險控制部、人力資源部）六個部門，集股份轉讓、登記結算、代理買賣、市場拓展、定向增資、企業并購等多種金融服務業務于一體，為一、二級市場投資者提供多樣化的金融產品和綜合服務。

2012年2月15日，上海股權托管交易中心啟動，首批19家企業成功掛牌。中央政治局常委（時任上海市委書記）俞正聲，中央政治局委員、上海市委書記、市長韓正，上海市委常委、副市長屠光紹，上海市政協副主席、浦東新區區長姜梁等出席了啟動儀式。

上海股權托管交易中心致力于與中國證監會監管的證券市場實現對接，除為掛牌公司提供定向增資、重組購并、股份轉讓、價值挖掘、營銷宣傳等服務外，還對掛牌公司規范運作、信息披露等市場行為予以監管，努力為掛牌公司實現轉主板、中小板、創業板上市發揮培育、輔導和促進作用。

上海股權托管交易中心積極發揮“股份交易中心、資源集聚中心、上市孵化中心、金融創新中心”的功能，為掛牌公司和廣大投資者提供優質的服務，努力實現“規模可觀、服務一流、國內領先、國際知名”的奮斗目標。