科創(chuàng)板與新三板在上市定位、上市門檻、注冊審核流程、投資要求、交易方式、信息披露和退市監(jiān)管上都存在顯著差別。總的來看，科創(chuàng)板上市定位明確，注冊審核全流程電子化公開，上市門檻和投資要求的設(shè)置上綜合平衡風(fēng)險和流動性，擁有系統(tǒng)完善的信披機制和退市制度；而新三板作為場外試點注冊制的板塊，上市定位并不清晰，注冊審核流程十分簡易，上市門檻過于寬松，再疊加投資要求上的過高設(shè)置，缺少體系完備且執(zhí)行到位的信息披露和退市制度、導(dǎo)致市場流動性匱乏。

1、上市定位

科創(chuàng)板是首個場內(nèi)試點注冊制的增量板塊，定位于服務(wù)面向世界科技前沿、面向經(jīng)濟主戰(zhàn)場、面向國家重大需求，主要依靠核心技術(shù)開展生產(chǎn)經(jīng)營，具有穩(wěn)定的商業(yè)模式，市場認(rèn)可度高，具有較強成長性的企業(yè)，重點支持新一代信息技術(shù)、高端裝備、新材料、新能源、節(jié)能環(huán)保以及生物醫(yī)藥等六大領(lǐng)域。而新三板屬于場外市場，其成立之初主要服務(wù)北京中關(guān)村的高科技企業(yè)。2014年1月24日，新三板正式宣告成為全國性的證券交易市場，至此，新三板的上市定位已不僅僅局限于高科技企業(yè)。

2、注冊審核流程

科創(chuàng)板試點注冊制審核進度全流程電子化公開，企業(yè)需要經(jīng)歷提交申請、受理、問詢、上會、注冊等多個環(huán)節(jié)，尤其是多輪問詢的公開，在“問出一家真公司”的同時，幫助投資者更全面地了解擬上市公司；而新三板的注冊審核流程則明顯更加簡易寬松，掛牌流程相對簡單，企業(yè)向全國中小企業(yè)股份轉(zhuǎn)讓有限公司（下稱“全國股轉(zhuǎn)公司”）提交掛牌申請材料后，全國股轉(zhuǎn)公司有針對性地提出問詢，企業(yè)和項目組反饋之后，若無問題，在收到全國股轉(zhuǎn)公司的“無異議函”后即可辦理股權(quán)登記和簡稱、代碼分配。

3、上市門檻

針對不同性質(zhì)的企業(yè)，科創(chuàng)板設(shè)置了不同的上市標(biāo)準(zhǔn)。如針對境內(nèi)同股同權(quán)的企業(yè)，設(shè)置了五套以市值為核心的上市標(biāo)準(zhǔn)，具體指標(biāo)涉及市值、營收、凈利、現(xiàn)金流以及研發(fā)費用等多個指標(biāo)的多種組合，且隨著企業(yè)經(jīng)營穩(wěn)定性的降低，對市值等指標(biāo)的要求就越高。相比之下，新三板的掛牌要求則寬松得多，多為規(guī)范性的定性要求，如果僅僅是掛牌，硬性量化指標(biāo)僅需經(jīng)營滿兩年。過低的掛牌門檻，導(dǎo)致新三板企業(yè)良莠不齊，多數(shù)質(zhì)地一般。

4、投資要求

科創(chuàng)板對個人投資者設(shè)置了2年以上投資經(jīng)驗和50萬元總資產(chǎn)的投資門檻，并沒有特別針對機構(gòu)投資者設(shè)置相應(yīng)要求，而新三板對個人和機構(gòu)投資者均設(shè)定了較高的門檻，其中個人新三板開戶條件是2年以上證券投資經(jīng)驗和投資者本人名下前一交易日日終證券類資產(chǎn)市值在500萬元人民幣以上，明顯高于科創(chuàng)板。過高的投資者門檻，使得一般只有規(guī)模較大的投資者才能參與新三板交易。

5、交易方式

科創(chuàng)板的交易方式更加多樣，除了競價方式和大宗交易等方式外，科創(chuàng)板還新增了盤后固定價格交易方式，成為盤中連續(xù)交易的有效補充。而新三板以做市交易為主，以促進市場流動性。同時，新三板企業(yè)掛牌時無公開發(fā)行環(huán)節(jié)，掛牌初期多數(shù)企業(yè)股票成交低迷。

6、信披和退市監(jiān)管

科創(chuàng)板建立了系統(tǒng)完善的信息披露機制以及退市制度，其中退市制度總體比主板更為嚴(yán)格，退市情形更多、也更加徹底。而新三板雖然掛牌公司所有擬披露的信息都需要經(jīng)過主辦券商的事前審查，但并沒有對后者在此環(huán)節(jié)中擔(dān)負(fù)的責(zé)任作詳細(xì)規(guī)定，信披違規(guī)處罰力度也較輕。同時，新三板也沒有完備而嚴(yán)格的退市制度，導(dǎo)致其新陳代謝并不順暢。