盡管一年來北交所取得了一定的成績，但有三個方面的問題須引起警覺。首先是流動性問題。由于建立了投資者適當性管理制度，如同兩融業務、股指期貨等一樣，北交所也將市場中眾多的中小投資者擋在了大門之外。更何況，北交所由于企業自身的特點，以及市場本身的屬性，也會讓部分投資者對其敬而遠之。北交所諸多個股出現的心電圖走勢，以及超低的換手率，客觀上并不利于該市場的發展。

其次是北交所的板塊定位問題。北交所主要定位于創新型中小企業，重點支持“專精特新”型中小企業的發展，這一定位是非常明確的。但如何堅守這一定位，卻是北交所必須直面的問題。像創業板在堅守板塊定位上曾經迷失，養殖企業溫氏股份（300498）曾成為“創業板一哥”即是明證。北交所要避免重走創業板的老路。

第三是北交所對于掛牌公司的吸引力問題。自北交所開市至今，已先后有觀典防務轉板科創板、泰祥股份（301192）與翰博高新（301321）轉板創業板等三起成功轉板案例。這對于北交所來說并不是好消息，也凸顯出北交所對于這些轉板企業吸引力的缺失。為了防止更多北交所企業轉板，提升北交所的吸引力也是當務之急。