北京證券交易所設立，對新三板市場無疑是重大改革利好。受此影響，新三板市場正發生兩方面變化。有市場分析人士指出，一是，市場表現上，精選層表現強勢，并帶動創新層、基礎層，新三板市場整體走強；二是，精選層二級市場估值上漲空間已經體現。

從盤面來看，本周一（9月6日），精選層表現強勢。當天收盤，66只個股全部上漲，其中3股漲停，平均漲幅14.07%。盤中合計成交37.94億元，創歷史新高，環比增加45.58%，平均換手率7.21%，較上個交易日提升2.3個百分點。

值得關注的是，在精選層行情帶動下，創新層、基礎層亦表現亮眼。

當天，創新層、基礎層分別成交15.66億元、1.02億元，環比分別增加124.69%、72.42%。做市指數、創新成指、三板成指分別上漲12.99%、6.92%、4.86%。

上周，證監會明確，北京證券交易所承接在創新層、基礎層發展壯大的創新型中小企業，對創新層、基礎層形成示范引領和“反哺”功能。上述分析人士認為，精選層帶動新三板市場整體走強，充分體現了市場機制對本次改革重要安排做出了有效反應。

同時，估值方面，設立北交所消息發布前，精選層二級市場估值相對較低，市盈率中位數為23.46倍。

9月6日，今日上漲后，精選層股票市盈率中位數為27.49倍，估值得到一定程度修復。

對比來看，目前，科創50成分股市盈率中位數為78.53倍，創業板指成分股市盈率中位數為48.05倍。

市場人士認為，設立北京證券交易所后，目前精選層66家掛牌公司將全部直接轉變為上市公司，投資者將不再以掛牌公司的眼光看待精選層估值，受上市地位明確和流動性改善預期帶動，預計精選層整體估值還存在較大上漲空間。